المركز الوطني للوقاية من الأمراض السارية والمتوطنة ومكافحتها يسعى وبشكل مستمر في ربط آفاق للتعاون مع الجهات الشعبية الرسمية والمنظمات والجمعيات الأهلية من أجل المساهمة في رفع مستوى كفاءة العاملين بكافة القطاعات .
وبهذا عمل المركز على توقيع سلسلة من الإتفاقيات مع عدد من المنظمات الدولية والمحلية الأهلية في الجماهيرية تمثلت في الإتفاقيات التالية :-
مركز تقنيات البحوث الحيوية
المنظمة الوطنية للشباب الليبي
اللجنة الوطنية للعمل التطوعي الشبابي
الهيئة العامة للأوقاف وشؤون الزكاة
الحركة العامة للكشافة و المرشدات